O número CAS do Neuropeptídeo Y (porcino) é 83589-17-7; tem a fórmula molecular C190H287N55O57 e um peso molecular de aproximadamente 4253,70. O neuropeptídeo Y (humano/rato) possui o número CAS 90880-35-6, a fórmula molecular C189H285N55O57S e um peso molecular de aproximadamente 4271,68; o armazenamento normalmente requer refrigeração a -20 graus. O NPY possui uma conformação única em forma de gancho, conhecida como dobra de "polipeptídeo pancreático".
O neuropeptídeo Y está amplamente distribuído por todo o sistema nervoso central; sua concentração é mais alta no hipocampo, seguido pelo córtex cerebral, hipotálamo, tálamo, tronco cerebral e cerebelo. O núcleo arqueado do hipotálamo é um local primário de síntese de NPY. Populações específicas de neurônios que expressam NPY- são encontradas no núcleo dorsal da rafe e na substância cinzenta periaquedutal ventrolateral do tronco cerebral. No sistema nervoso periférico, o NPY co-localiza-se principalmente com a noradrenalina nos nervos simpáticos e é liberado pelas terminações nervosas simpáticas. O sistema cardiovascular contém fibras nervosas NPY abundantes, com o NPY amplamente distribuído ao redor do coração e dos vasos sanguíneos.
